Τα Τμήματα Λογιστικής και Χρηματοοικονομικής της Σχολής Διοίκησης και Οικονομίας του ΤΕΙ Κρήτης και Λογιστικής και Χρηματοοικονομικής της Σχολής Επιστημών Διοίκησης Επιχειρήσεων του Πανεπιστημίου Μακεδονίας.
Τα Τμήματα Ηλεκτρολόγων Μηχανικών Τ.Ε. και Μηχανολόγων Μηχανικών Τ.Ε. της Σχολής Τεχνολογικών Εφαρμογών του Τεχνολογικού Εκπαιδευτικού Ιδρύματος Κρήτης, λειτουργούν το Δ.Π.Μ.Σ. με τίτλο: «Ενεργειακά Συστήματα». Το Δ.Π.Μ.Σ.
Το Τμήμα Λογιστικής και Χρηματοοικονομικής της Σχολής Διοίκησης και Οικονομίας του Τεχνολογικού Εκπαιδευτικού Ιδρύματος Κρήτης οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο: Π.Μ.Σ. «Χρηματοοικονομική Διοίκηση». Η χρονική διάρκεια για την απονομή του Μ.Δ.Ε.
Το Τμήμα Μηχανικών Μουσικής Τεχνολογίας και Ακουστικής (Μ.Μ.Τ.Α) της Σχολής Εφαρμοσμένων Επιστημών του Τεχνολογικού Εκπαιδευτικού Ιδρύματος Κρήτης οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (Π.Μ.Σ.) με τίτλο «Τεχνολογίες Ήχου και Μουσικής - Sound & Music Technologies».
Το Τμήμα Χημείας της Σχολής Θετικών και Τεχνολογικών Επιστημών του Πανεπιστημίου Κρήτης συνδιοργανώνει και λειτουργεί με τα Τμήματα Ηλεκτρολόγων Μηχανικών Τ.Ε. της Σχολής Τεχνολογικών Εφαρμογών και Τεχνολόγων Γεωπόνων της Σχολής Τεχνολογίας Γεωπονίας και Τεχνολογίας Τροφίμων του ΤΕΙ Κρήτης.
Το Τμήμα Διοίκησης Επιχειρήσεων με έδρα το Ηράκλειο, της Σχολής Διοίκησης και Οικονομίας του ΤΕΙ Κρήτης, λειτουργεί το Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο: «Διοίκηση Επιχειρήσεων Φιλοξενίας και Τουρισμού». Το Π.Μ.Σ.
Το Τμήμα Κοινωνικής Εργασίας του ΤΕΙ Κρήτης οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (Π.Μ.Σ.) με τίτλο "Διαμεθοδικές Κοινωνικές Παρεμβάσεις σε Καταστάσεις Κρίσης" στις ακόλουθες κατευθύνσεις: 1. Παρεμβάσεις Κοινωνικής Εργασίας σε καταστάσεις κρίσης στην οικογένεια 2.
Το Τμήμα Ηλεκτρονικών Μηχανικών Τ.Ε. της Σχολής Εφαρμοσμένων Επιστημών του Τεχνολογικού Εκπαιδευτικού Ιδρύματος Κρήτης οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (Π.Μ.Σ.) με τίτλο «Ηλεκτρονικά Συστήματα Τηλεπικοινωνιών και Αυτοματισμών» (Master of Science in Telecommunication and.
Το Τμήμα Νοσηλευτικής της Σχολής Επαγγελμάτων Υγείας Πρόνοιας του Τεχνολογικού Εκπαιδευτικού Ιδρύματος Κρήτης λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο: «Προηγμένη Κλινική Πρακτική στις Επιστήμες Υγείας» (Μ.Sc - Master of Science in Advanced Clinical Practice in Health Sciences). Το Π.Μ.Σ.
Το Τμήμα Μηχανικών Φυσικών Πόρων & Περιβάλλοντος του ΤΕΙ Κρήτης οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (Π.Μ.Σ.) με τίτλο «Γεωπεριβαλλοντικοί Πόροι & Κίνδυνοι (Geoenvironmental Resources & Risks)». Το Π.Μ.Σ. έχει συνολική διάρκεια τρία (3) εξάμηνα.